20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0340 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0340  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0850  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2224  hypothetical protein  35.9 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.934488 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0766  hypothetical protein  37.43 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.0216874 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1997  hypothetical protein  35.68 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0904  hypothetical protein  34.55 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.416316  normal  0.574493 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.14 
 
 
299 aa  47.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 
571 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  27.33 
 
 
645 aa  44.7  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.01 
 
 
644 aa  44.7  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24861  esterase  33.33 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  24.14 
 
 
280 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  30.34 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  30.25 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
645 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
645 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.82 
 
 
645 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  26.13 
 
 
262 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  32.74 
 
 
307 aa  41.2  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.75 
 
 
645 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>