15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5419 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010727  Mpop_5419    100 
 
 		 1201 bp  2381    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  85.51 
 
 		 1149 bp  868    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  81.82 
 
 		 1161 bp  214  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  86.07 
 
 		 1200 bp  107  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  84.55 
 
 		 1164 bp  93.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  88.06 
 
 		 1233 bp  69.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  83 
 
 		 1203 bp  63.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  81.82 
 
 		 1140 bp  60  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  81.03 
 
 		 1164 bp  56  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  83.13 
 
 		 1149 bp  54  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  80.95 
 
 		 1173 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4391  amidase  96.55 
 
 		 1287 bp  50.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  85.25 
 
 		 1257 bp  50.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  85.71 
 
 		 1290 bp  48.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  87.5 
 
 		 1212 bp  48.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>