33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0023 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0023  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451348  normal  0.87366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0041  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.541052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0036  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.380144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0037  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 119 bp  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.234158 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0040  5S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 119 bp  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.344564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  87.13 
 
 		 121 bp  97.6  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0024  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 119 bp  97.6  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.683593  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0044  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0043  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0043  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 122 bp  56  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0025  5S ribosomal RNA  81.82 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0046  5S ribosomal RNA  81.82 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0025  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639002  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0056  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0213918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0034  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0021  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 122 bp  46.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 118 bp  46.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0026  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0050  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1832  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.172239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1705  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0166  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0022  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1370  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 36 bp  44.1  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0656  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 36 bp  44.1  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.757563  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 115 bp  44.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>