17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0025 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0025  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0046  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0044  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 131 bp  71.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0069  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 131 bp  71.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0021  5S ribosomal RNA  84 
 
 		 131 bp  71.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0041  5S ribosomal RNA  81.82 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.541052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0036  5S ribosomal RNA  81.82 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.380144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0023  5S ribosomal RNA  81.82 
 
 		 122 bp  54  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451348  normal  0.87366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  54  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 122 bp  48.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0057  5S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0058  5S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0013  5S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0014  5S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0038  5S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 122 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0039  5S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
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