13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2662 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2662  TonB box domain protein  100 
 
 
139 aa  281  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000144725  normal  0.74286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1791  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  128  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.80311  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0753  hypothetical protein  44.37 
 
 
130 aa  110  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.479665  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2233  hypothetical protein  45.99 
 
 
138 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0911  hypothetical protein  40.69 
 
 
145 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254851  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1221  hypothetical protein  38.19 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0142  hypothetical protein  39.86 
 
 
137 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2910  hypothetical protein  32.39 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0812  hypothetical protein  60.61 
 
 
239 aa  57.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3776  hypothetical protein  58.82 
 
 
347 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2744  hypothetical protein  60.61 
 
 
240 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1927  Protein of unknown function DUF2072, Zinc-ribbon  55.88 
 
 
388 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1617  hypothetical protein  57.58 
 
 
262 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>