13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2744 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2744  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  481  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1617  hypothetical protein  43.94 
 
 
262 aa  176  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0812  hypothetical protein  38.2 
 
 
239 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3776  hypothetical protein  57.27 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1927  Protein of unknown function DUF2072, Zinc-ribbon  69.84 
 
 
388 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0753  hypothetical protein  66.67 
 
 
130 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.479665  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1791  hypothetical protein  63.64 
 
 
125 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.80311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2233  hypothetical protein  60.61 
 
 
138 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0911  hypothetical protein  60.61 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254851  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0142  hypothetical protein  57.58 
 
 
137 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2662  TonB box domain protein  60.61 
 
 
139 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000144725  normal  0.74286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1221  hypothetical protein  48.72 
 
 
142 aa  48.9  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2910  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.610007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>