10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1676 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0922    91.62 
 
 		 1160 bp  1457    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0219057  normal  0.0595715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1440    96.66 
 
 		 1107 bp  1901    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1509    91.14 
 
 		 1162 bp  1417    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.719647  decreased coverage  0.00853112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1676    100 
 
 		 1113 bp  2206    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2260    90.66 
 
 		 1159 bp  1376    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0847    91.37 
 
 		 255 bp  331  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0196849  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1446    90.22 
 
 		 455 bp  222  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2178    77.95 
 
 		 1002 bp  176  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.424321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2001  hypothetical protein  83.58 
 
 		 186 bp  91.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.372316  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2643  hypothetical protein  100 
 
 		 129 bp  52  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.362494  normal  0.0784272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>