10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2260 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0922    90.78 
 
 		 1160 bp  1439    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0219057  normal  0.0595715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1440    90.97 
 
 		 1107 bp  1396    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1509    89.51 
 
 		 1162 bp  1318    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.719647  decreased coverage  0.00853112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1676    90.66 
 
 		 1113 bp  1376    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2260    100 
 
 		 1159 bp  2298    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0847    89.71 
 
 		 255 bp  283  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0196849  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1446    85.95 
 
 		 455 bp  208  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2178    79.35 
 
 		 1002 bp  129  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.424321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2001  hypothetical protein  84.4 
 
 		 186 bp  81.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.372316  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2643  hypothetical protein  91.89 
 
 		 129 bp  50.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.362494  normal  0.0784272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>