9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1509 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0922    90.12 
 
 		 1160 bp  1378    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0219057  normal  0.0595715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1440    90.28 
 
 		 1107 bp  1334    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1509    100 
 
 		 1162 bp  2303    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.719647  decreased coverage  0.00853112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1676    91.14 
 
 		 1113 bp  1417    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2260    89.51 
 
 		 1159 bp  1318    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0847    93.36 
 
 		 255 bp  365  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0196849  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1446    86.11 
 
 		 455 bp  212  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2178    87.5 
 
 		 1002 bp  87.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.424321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2001  hypothetical protein  83.64 
 
 		 186 bp  75.8  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.372316  normal  0.265283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>