10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0922 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0922    100 
 
 
1160 bp  2300    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0219057  normal  0.0595715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1440    92.43 
 
 
1107 bp  1526    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1509    90.12 
 
 
1162 bp  1378    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.719647  decreased coverage  0.00853112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1676    91.62 
 
 
1113 bp  1457    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2260    90.78 
 
 
1159 bp  1439    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0847    93.28 
 
 
255 bp  367  5.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0196849  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1446    88.52 
 
 
455 bp  196  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2178    78.13 
 
 
1002 bp  131  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.424321  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2001  hypothetical protein  85.71 
 
 
186 bp  119  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.372316  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2643  hypothetical protein  92.5 
 
 
129 bp  56  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.362494  normal  0.0784272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>