16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1154 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1154  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 162 aa  323  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.501074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2112  helix-turn-helix domain-containing protein  71.43 
 
 		 162 aa  241  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2739  transcriptional regulator, XRE family  60.25 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0106  helix-turn-helix domain-containing protein  58.39 
 
 		 161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0501  XRE family transcriptional regulator  56.17 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0071  XRE family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 161 aa  188  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1033  XRE family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 173 aa  120  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0808  hypothetical protein  35.9 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1633  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2130  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.120661  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0738  helix-turn-helix domain-containing protein  39.58 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0931337  normal  0.163713 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0078  XRE family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1175  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0743  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1289  hypothetical protein  37.34 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2448  hypothetical protein  48.08 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>