19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_R0090 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_R0090  tRNA-Arg  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0007  tRNA-Met  100 
 
 
73 bp  54  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849736  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0078  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  54  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0983896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0078  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  54  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105047  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0832  tRNA-Met  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0075  tRNA-Lys  93.55 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0374  tRNA-Met  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2383  tRNA-Met  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2524  tRNA-Met  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1714  tRNA-Met  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199477  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1521  tRNA-Met  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0622  tRNA-Met  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Met-1  tRNA-Met  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.495434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>