18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2895 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2895  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2939  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203241  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2925  hypothetical protein  94.87 
 
 
124 aa  219  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1305  CsbD family protein  78.38 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2022  CsbD family protein  82.43 
 
 
77 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705575  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4701  CsbD family protein  75.61 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1293  CsbD family protein  81.08 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48173  normal  0.157127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1276  CsbD-like protein  81.08 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1657  CsbD family protein  54.05 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4791  hypothetical protein  67.57 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586089  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2564  hypothetical protein  68.42 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3881  CsbD family protein  66 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00120  hypothetical protein  52.86 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8238  normal  0.172694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3461  CsbD family protein  53.49 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3398  CsbD-like protein  53.49 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.506921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3409  CsbD family protein  53.49 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.66946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5236  CsbD family protein  54.55 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00387932  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1034  CsbD-like protein  44.83 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.433839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>