16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3398 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3398  CsbD-like protein  100 
 
 
188 aa  331  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.506921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3461  CsbD family protein  100 
 
 
188 aa  331  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3409  CsbD family protein  100 
 
 
188 aa  331  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.66946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1034  CsbD-like protein  51.49 
 
 
184 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5236  CsbD family protein  53.24 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00387932  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2564  hypothetical protein  56.52 
 
 
78 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4701  CsbD family protein  53.19 
 
 
79 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2022  CsbD family protein  50 
 
 
77 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705575  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1305  CsbD family protein  47.14 
 
 
78 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1657  CsbD family protein  48.94 
 
 
98 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2895  hypothetical protein  53.49 
 
 
120 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2939  hypothetical protein  53.49 
 
 
120 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203241  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4791  hypothetical protein  46.81 
 
 
78 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586089  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2925  hypothetical protein  53.49 
 
 
124 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1276  CsbD-like protein  46.81 
 
 
78 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1293  CsbD family protein  46.81 
 
 
78 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48173  normal  0.157127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>