17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2022 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2022  CsbD family protein  100 
 
 
77 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705575  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1305  CsbD family protein  77.03 
 
 
78 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4701  CsbD family protein  93.33 
 
 
79 aa  100  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2895  hypothetical protein  82.43 
 
 
120 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2939  hypothetical protein  82.43 
 
 
120 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203241  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2925  hypothetical protein  82.43 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1293  CsbD family protein  78.38 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48173  normal  0.157127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1276  CsbD-like protein  78.38 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1657  CsbD family protein  74.32 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4791  hypothetical protein  74.32 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.586089  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2564  hypothetical protein  67.53 
 
 
78 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3881  CsbD family protein  65.38 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00120  hypothetical protein  48.05 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8238  normal  0.172694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3461  CsbD family protein  50 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3398  CsbD-like protein  50 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.506921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3409  CsbD family protein  50 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.66946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5236  CsbD family protein  52.27 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00387932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>