22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1970 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2246  hypothetical protein  98.21 
 
 		 118 aa  183  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0399381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1925  hypothetical protein  82.24 
 
 		 121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.116141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0165  hypothetical protein  63.74 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00168593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2600  hypothetical protein  58.06 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4594  hypothetical protein  61.11 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0410  hypothetical protein  54.26 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2456  hypothetical protein  50.54 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3841  hypothetical protein  51.06 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2883  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1450  hypothetical protein  51.95 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4612  hypothetical protein  46.53 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0079  hypothetical protein  51.65 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.554101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1509  hypothetical protein  49.46 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1356  hypothetical protein  43.48 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0062  hypothetical protein  46.46 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2050  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1665  hypothetical protein  45.95 
 
 		 102 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0603  hypothetical protein  35.51 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3695  hypothetical protein  36.51 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0590  hypothetical protein  42 
 
 		 93 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0627  hypothetical protein  42 
 
 		 93 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00327781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>