18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1665 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1665  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  200  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1356  hypothetical protein  48.89 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2050  hypothetical protein  47.13 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1903  hypothetical protein  55.56 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0124383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2456  hypothetical protein  45.76 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0590  hypothetical protein  65.91 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1450  hypothetical protein  41.18 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0627  hypothetical protein  65.91 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00327781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3695  hypothetical protein  65.91 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2883  hypothetical protein  44.07 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4612  hypothetical protein  42.37 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0079  hypothetical protein  47.89 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.554101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2600  hypothetical protein  58.14 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0410  hypothetical protein  58.14 
 
 
98 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3841  hypothetical protein  47.73 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1509  hypothetical protein  38.98 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0165  hypothetical protein  43.48 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00168593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1925  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.116141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>