17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2050 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2050  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1356  hypothetical protein  48.81 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1665  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0627  hypothetical protein  65.31 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00327781  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0590  hypothetical protein  65.31 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3695  hypothetical protein  65.31 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1903  hypothetical protein  56.92 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0124383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0079  hypothetical protein  47.69 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.554101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2456  hypothetical protein  46.81 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2883  hypothetical protein  47.06 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1450  hypothetical protein  46.81 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3841  hypothetical protein  54.76 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4612  hypothetical protein  46.81 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0165  hypothetical protein  56.1 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00168593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2600  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0410  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1925  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.116141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>