22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0062 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  206  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2600  hypothetical protein  51.58 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0410  hypothetical protein  65.28 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2883  hypothetical protein  48 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2456  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3841  hypothetical protein  44.79 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4612  hypothetical protein  50.53 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0079  hypothetical protein  54.43 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.554101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1450  hypothetical protein  48.42 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1925  hypothetical protein  47.87 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.116141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0165  hypothetical protein  57.33 
 
 		 101 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00168593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1509  hypothetical protein  49.44 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1970  hypothetical protein  46.46 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4594  hypothetical protein  51.22 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2246  hypothetical protein  45.54 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0399381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2050  hypothetical protein  49.21 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0603  hypothetical protein  54.55 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1356  hypothetical protein  47.54 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0590  hypothetical protein  47.3 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0627  hypothetical protein  47.3 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00327781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3695  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1665  hypothetical protein  37.66 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>