18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5476 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5476    100 
 
 		 267 bp  529  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0010  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  89.36 
 
 		 2295 bp  54  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00266104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  89.36 
 
 		 1551 bp  54  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0849  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  92.11 
 
 		 1557 bp  52  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  85.71 
 
 		 843 bp  48.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  87.23 
 
 		 2283 bp  46.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  87.23 
 
 		 1983 bp  46.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  87.23 
 
 		 2181 bp  46.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5512  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  87.23 
 
 		 2241 bp  46.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294754  normal  0.0542916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  100 
 
 		 1602 bp  46.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  87.23 
 
 		 2304 bp  46.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  87.23 
 
 		 2283 bp  46.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  87.23 
 
 		 2283 bp  46.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  87.23 
 
 		 2304 bp  46.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  87.23 
 
 		 2283 bp  46.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4959  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  87.23 
 
 		 2241 bp  46.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00168647  normal  0.0243136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2366  sensor histidine kinase/response regulator  87.23 
 
 		 2307 bp  46.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00256663  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  87.23 
 
 		 2178 bp  46.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>