21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1253 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2290    96.63 
 
 
689 bp  1172    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1800    97.07 
 
 
682 bp  1187    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1668    96.63 
 
 
683 bp  1172    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1400    97.66 
 
 
689 bp  1227    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1253    100 
 
 
683 bp  1354    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.2115  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1021    96.08 
 
 
664 bp  1110    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1018    95.46 
 
 
683 bp  1108    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0975    98.24 
 
 
683 bp  1259    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.632925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0087    97.66 
 
 
689 bp  1227    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0410    98.83 
 
 
683 bp  1291    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3169  hypothetical protein  85.57 
 
 
555 bp  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000436228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0043  hypothetical protein  87.32 
 
 
339 bp  323  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000166615  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3161  hypothetical protein  86.15 
 
 
420 bp  319  6e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.446465  hitchhiker  0.00206023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1329  hypothetical protein  85.87 
 
 
420 bp  311  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1325  hypothetical protein  85.87 
 
 
420 bp  311  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00014986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0042  hypothetical protein  86.42 
 
 
381 bp  266  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000215832  normal  0.0470147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1328  hypothetical protein  88.6 
 
 
228 bp  246  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1324  hypothetical protein  88.6 
 
 
228 bp  246  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000817472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3162  hypothetical protein  87.72 
 
 
228 bp  230  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00204659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3170  hypothetical protein  88.46 
 
 
126 bp  111  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000334822 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1613    85.71 
 
 
321 bp  48.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>