24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1018 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2290    96.78 
 
 
689 bp  1179    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1800    96.63 
 
 
682 bp  1164    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1668    96.78 
 
 
683 bp  1179    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1400    96.05 
 
 
689 bp  1140    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1253    95.46 
 
 
683 bp  1108    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.2115  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1021    94.58 
 
 
664 bp  1031    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1018    100 
 
 
683 bp  1354    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0975    95.46 
 
 
683 bp  1108    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.632925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0087    96.05 
 
 
689 bp  1140    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0410    95.61 
 
 
683 bp  1116    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3169  hypothetical protein  84.08 
 
 
555 bp  345  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000436228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0043  hypothetical protein  86.93 
 
 
339 bp  303  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000166615  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3161  hypothetical protein  84.55 
 
 
420 bp  270  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.446465  hitchhiker  0.00206023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1329  hypothetical protein  83.71 
 
 
420 bp  246  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1325  hypothetical protein  83.71 
 
 
420 bp  246  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00014986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1328  hypothetical protein  88.99 
 
 
228 bp  242  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1324  hypothetical protein  88.99 
 
 
228 bp  242  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000817472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3162  hypothetical protein  88.57 
 
 
228 bp  226  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00204659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0042  hypothetical protein  84.07 
 
 
381 bp  204  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000215832  normal  0.0470147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3170  hypothetical protein  88.46 
 
 
126 bp  111  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000334822 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1613    93.02 
 
 
321 bp  61.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1591    90.7 
 
 
297 bp  54  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.324578 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1824    90.7 
 
 
279 bp  54  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.648687 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1853    90.7 
 
 
267 bp  54  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0502569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>