17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1399 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1399  transposase, putative  100 
 
 
231 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.225081  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2555  transposase, putative  59.21 
 
 
354 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000867882  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2758  transposase, putative  59.21 
 
 
354 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189488  normal  0.0138803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0038  transposase, putative  59.21 
 
 
354 aa  299  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00111468  normal  0.0316372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0799  transposase, putative  59.21 
 
 
354 aa  298  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1266  transposase, putative  59.21 
 
 
354 aa  299  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3290  transposase, putative  59.21 
 
 
354 aa  299  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3303  transposase, putative  58.77 
 
 
354 aa  296  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.356059  normal  0.100304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0017  transposase, putative  57.05 
 
 
278 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222637  normal  0.0337825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1670  transposase, putative  38.7 
 
 
248 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00916168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3083  transposase, IS4  38.7 
 
 
305 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.291285  normal  0.365369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0437  transposase, putative  59.5 
 
 
243 aa  164  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1927  transposase, putative  61.74 
 
 
242 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00509711  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2433  transposase, putative  60.87 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0162116  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2434  transposase, putative  56.3 
 
 
137 aa  148  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131194  normal  0.314095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1926  transposase, putative  56.3 
 
 
137 aa  148  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.155953  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0018  hypothetical protein  69.64 
 
 
67 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148317  normal  0.0289436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>