42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0038 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3303  transposase, putative  98.87 
 
 
354 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.356059  normal  0.100304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0038  transposase, putative  100 
 
 
354 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00111468  normal  0.0316372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0799  transposase, putative  99.44 
 
 
354 aa  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1266  transposase, putative  99.72 
 
 
354 aa  715    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3290  transposase, putative  99.44 
 
 
354 aa  713    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2758  transposase, putative  99.15 
 
 
354 aa  709    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189488  normal  0.0138803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2555  transposase, putative  99.44 
 
 
354 aa  712    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000867882  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0017  transposase, putative  98.56 
 
 
278 aa  555  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222637  normal  0.0337825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0437  transposase, putative  99.18 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1927  transposase, putative  99.16 
 
 
242 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00509711  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2433  transposase, putative  97.89 
 
 
242 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0162116  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1399  transposase, putative  59.21 
 
 
231 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.225081  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3083  transposase, IS4  45.29 
 
 
305 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.291285  normal  0.365369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1670  transposase, putative  47.37 
 
 
248 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00916168  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2434  transposase, putative  97.5 
 
 
137 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131194  normal  0.314095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1926  transposase, putative  97.5 
 
 
137 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.155953  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0018  hypothetical protein  98.33 
 
 
67 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148317  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1398  transposase, putative  57 
 
 
101 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.466616  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  24.55 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  24.55 
 
 
306 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  23.65 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  31.52 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  31.52 
 
 
306 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  31.52 
 
 
306 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  31.52 
 
 
306 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  31.52 
 
 
306 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  31.52 
 
 
306 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  32.1 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  32.1 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  30.43 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  30.43 
 
 
220 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  23.79 
 
 
316 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  29.35 
 
 
289 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>