16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0414 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0414  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  215  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4106  protein of unknown function DUF1375  33 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01047  predicted lipoprotein  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0125641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2595  protein of unknown function DUF1375  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1173  hypothetical protein  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0826653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1172  hypothetical protein  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.15827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0047  hypothetical protein  34.09 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2549  hypothetical protein  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0255653  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2079  hypothetical protein  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2279  hypothetical protein  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1430  hypothetical protein  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.193761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01055  hypothetical protein  34.52 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0192844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1566  hypothetical protein  35.8 
 
 		 75 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489739  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4144  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3796  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0010  hypothetical protein  33.7 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>