38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1173 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01047  predicted lipoprotein  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0125641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2595  protein of unknown function DUF1375  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01055  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0192844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2279  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2079  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1173  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0826653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.193761 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.15827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2549  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0255653  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1566  hypothetical protein  85.33 
 
 		 75 aa  138  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489739  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1263  hypothetical protein  91.04 
 
 		 67 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1248  hypothetical protein  91.04 
 
 		 67 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.370829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1219  hypothetical protein  91.04 
 
 		 67 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542601  normal  0.268436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2037  hypothetical protein  91.04 
 
 		 67 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2221  hypothetical protein  91.04 
 
 		 67 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.837377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1872  hypothetical protein  66.67 
 
 		 82 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1663  hypothetical protein  64.86 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.70488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1554  hypothetical protein  64.86 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0047  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0012  hypothetical protein  37.18 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.554308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3796  hypothetical protein  39.24 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0010  hypothetical protein  39.24 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4144  hypothetical protein  39.24 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03515  hypothetical protein  34.15 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03571  conserved outer membrane protein  34.15 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4231  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0015  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4197  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3900  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0015  protein of unknown function DUF1375  34.15 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4037  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0414  hypothetical protein  34.52 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4020  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4199  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0038  hypothetical protein  34.52 
 
 		 124 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0033  hypothetical protein  38.71 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3915  protein of unknown function DUF1375  32.5 
 
 		 123 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4106  protein of unknown function DUF1375  30.77 
 
 		 123 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>