43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4106 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4106  protein of unknown function DUF1375  100 
 
 
123 aa  254  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3915  protein of unknown function DUF1375  62.39 
 
 
123 aa  150  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0033  hypothetical protein  54.37 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0038  hypothetical protein  55.34 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0047  hypothetical protein  52.08 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.320831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4144  hypothetical protein  45.71 
 
 
112 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3796  hypothetical protein  45.71 
 
 
112 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0010  hypothetical protein  44.76 
 
 
112 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0012  hypothetical protein  39.66 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.554308  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03571  conserved outer membrane protein  39.82 
 
 
110 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0015  protein of unknown function DUF1375  39.82 
 
 
110 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03515  hypothetical protein  39.82 
 
 
110 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4231  hypothetical protein  39.82 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0015  hypothetical protein  39.82 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4197  hypothetical protein  39.82 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3900  hypothetical protein  39.82 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4037  hypothetical protein  43.3 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4020  hypothetical protein  42.71 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4199  hypothetical protein  42.71 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4141  hypothetical protein  39.56 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4092  hypothetical protein  39.56 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4053  hypothetical protein  43.84 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5121  hypothetical protein  43.84 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.180552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1181  hypothetical protein  47.46 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.731891  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1368  lipoprotein, putative  45.76 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00111167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000251  hypothetical protein  40.32 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0414  hypothetical protein  33 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2221  hypothetical protein  37.31 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.837377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2037  hypothetical protein  37.31 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1219  hypothetical protein  37.31 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542601  normal  0.268436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1263  hypothetical protein  37.31 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1248  hypothetical protein  37.31 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.370829  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1663  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.70488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1554  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1172  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.15827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2279  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1173  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0826653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1430  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.193761 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2549  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0255653  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01055  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0192844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2079  hypothetical protein  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2595  protein of unknown function DUF1375  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01047  predicted lipoprotein  30.77 
 
 
75 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0125641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>