17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R21 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_R21  tRNA-Trp  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0598636  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0586  tRNA-Sec  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0213801  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0623  tRNA-Trp  86.49 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0130  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.108428  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0107  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000447975  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0030  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.327508  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2130  tRNA-Trp  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2420  tRNA-Trp  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>