47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4149 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4149  transposition helper protein  100 
 
 		 54 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  73.47 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  67.35 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  72.34 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3103  transposase IS3/IS911 family protein  72.34 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  46.3 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  46.3 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  46.3 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  62.16 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0301  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.601541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  37.78 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00033  transposition helper protein  51.35 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>