58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1302 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1302  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.121261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0183  hypothetical protein  68.75 
 
 		 68 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0265  hypothetical protein  65.62 
 
 		 68 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0507  hypothetical protein  63.08 
 
 		 67 aa  86.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0255  hypothetical protein  64.06 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0202  hypothetical protein  68.33 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0317  hypothetical protein  65 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3551  hypothetical protein  82.22 
 
 		 46 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.772899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0148  hypothetical protein  57.38 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2476  hypothetical protein  61.02 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0204  hypothetical protein  56.25 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2679  hypothetical protein  56.52 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5963  hypothetical protein  56.52 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2552  hypothetical protein  56.52 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733693  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2661  hypothetical protein  53.62 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2021  hypothetical protein  53.62 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2632  hypothetical protein  53.62 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0829  hypothetical protein  52.17 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2420  hypothetical protein  52.17 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0587  hypothetical protein  52.17 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0833  hypothetical protein  52.17 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0033  hypothetical protein  52.17 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0292  hypothetical protein  52.17 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0659  hypothetical protein  52.17 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.619308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0991  hypothetical protein  52.17 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0666  hypothetical protein  53.62 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0625  hypothetical protein  48.53 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000281892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0685  hypothetical protein  52.17 
 
 		 64 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.532051  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3281  hypothetical protein  52.17 
 
 		 64 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0455  hypothetical protein  50.72 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.445992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0566  hypothetical protein  42.65 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0487  hypothetical protein  39.71 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0492  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0474  hypothetical protein  39.71 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2135  hypothetical protein  49.15 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1061  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0702  hypothetical protein  47.37 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00942627  hitchhiker  0.000000331825 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0546  hypothetical protein  47.37 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.823502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0546  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000158423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3295  hypothetical protein  48.33 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1534  hypothetical protein  42.62 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0304  hypothetical protein  50.98 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0535  hypothetical protein  39.06 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.303482  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0302  Zinc finger, CHCC-type  45.61 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.651805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1819  hypothetical protein  39.34 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2264  hypothetical protein  48.21 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0466  hypothetical protein  46.67 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0067  hypothetical protein  52.5 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02626  hypothetical protein  47.5 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0081  hypothetical protein  52.5 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2791  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1208  hypothetical protein  38.81 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3349  hypothetical protein  47.5 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2134  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2750  hypothetical protein  46.15 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2623  hypothetical protein  46.15 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1854  hypothetical protein  43.59 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0335  hypothetical protein  43.59 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>