25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08260  nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation  100 
 
 
190 aa  362  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00581079  normal  0.43805 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08240  MAF protein  74.63 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1013  maf protein  59.38 
 
 
232 aa  61.2  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.374037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  55.56 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.017605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3911  maf protein  52.05 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.487608  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25490  MAF protein  48.39 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.124397  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05870  Maf-like protein  48.48 
 
 
223 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.538428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1035  maf protein  51.56 
 
 
221 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.611513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1838  maf protein  49.23 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.244014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1272  maf protein  50.79 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3504  maf protein  50 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7197  Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation-like protein  58.33 
 
 
257 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  49.23 
 
 
475 aa  45.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0851  maf protein  50.79 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6393  Maf-like protein  62.16 
 
 
206 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  47.62 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0794  maf protein  50 
 
 
240 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0145497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  47.69 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1041  maf protein  48.39 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407711  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  46.03 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4776  Maf-like protein  45.31 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.714834  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  46.03 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1674  Maf-like protein  45.31 
 
 
209 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  26.67 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1140  maf protein  61.11 
 
 
229 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>