27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2481 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2481  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 		 99 aa  196  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0433381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3559  putative substrate binding component of ABC transporter  43.16 
 
 		 330 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3639  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  36.96 
 
 		 330 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0786  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  44.71 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3724  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  40 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.928243  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5310  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  42.47 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4615  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  44.12 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0392  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.41 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0345  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.41 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0386  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.41 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4693  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  34.94 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3821  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.84 
 
 		 333 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0364  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  37.5 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0431  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  37.5 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1231  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  37.5 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.43 
 
 		 333 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4371  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3265  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.41 
 
 		 335 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3398  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.41 
 
 		 335 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0927  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.41 
 
 		 367 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.582845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2410  putative sugar-binding periplasmic protein  32.81 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2309  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  32.81 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2854  putative secreted solute-binding lipoprotein  48.98 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3320  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  38.18 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0030  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  29.03 
 
 		 324 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.740399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4328  putative ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  34.38 
 
 		 329 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4063  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.33 
 
 		 332 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>