15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3508 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3508  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  780    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3744  hypothetical protein  30.53 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  28.57 
 
 
1578 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1327  hypothetical protein  33.64 
 
 
552 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0492  hypothetical protein  28.93 
 
 
884 aa  56.2  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4208  hypothetical protein  31.4 
 
 
486 aa  53.1  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0478  hypothetical protein  34.31 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0365  putative glycyl aminopeptidase  28.88 
 
 
715 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147236  normal  0.340206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0052  hypothetical protein  37.04 
 
 
377 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  28.57 
 
 
729 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1034  hypothetical protein  34.18 
 
 
1161 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2016  hypothetical protein  24.85 
 
 
868 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0853096  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1869  hypothetical protein  34.57 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  27.67 
 
 
1374 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2635  hypothetical protein  30.77 
 
 
452 aa  43.5  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>