18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0400 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0400  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1146    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2199  hypothetical protein  51.32 
 
 
598 aa  476  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0974  hypothetical protein  37.06 
 
 
591 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0401  hypothetical protein  42.44 
 
 
502 aa  299  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0973  hypothetical protein  38.48 
 
 
610 aa  293  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2472  hypothetical protein  36.43 
 
 
595 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0201  hypothetical protein  37.5 
 
 
485 aa  243  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00798209  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0200  hypothetical protein  36.34 
 
 
443 aa  224  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14601  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2200  hypothetical protein  40.38 
 
 
592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.813612  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2412  hypothetical protein  29.64 
 
 
453 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1099  hypothetical protein  26.86 
 
 
480 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3118  hypothetical protein  30.88 
 
 
419 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.087045  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4877  hypothetical protein  24.09 
 
 
579 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3653  hypothetical protein  25.88 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000579216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2346  hypothetical protein  24.67 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4963  hypothetical protein  33 
 
 
528 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2120  hypothetical protein  22.27 
 
 
533 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2627  hypothetical protein  19.18 
 
 
530 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>