17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2472 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2472  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1195    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0200  hypothetical protein  35.84 
 
 
443 aa  240  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14601  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0400  hypothetical protein  34.87 
 
 
579 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0974  hypothetical protein  32.23 
 
 
591 aa  238  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2199  hypothetical protein  35.06 
 
 
598 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0201  hypothetical protein  35.66 
 
 
485 aa  229  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00798209  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0973  hypothetical protein  30.19 
 
 
610 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0401  hypothetical protein  33.79 
 
 
502 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2200  hypothetical protein  31.56 
 
 
592 aa  165  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.813612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3118  hypothetical protein  28.7 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.087045  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3653  hypothetical protein  25.73 
 
 
509 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000579216  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2412  hypothetical protein  26.57 
 
 
453 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1099  hypothetical protein  29.94 
 
 
480 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4877  hypothetical protein  23.59 
 
 
579 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2627  hypothetical protein  22.51 
 
 
530 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3214  hypothetical protein  48.24 
 
 
447 aa  47.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4963  hypothetical protein  30.77 
 
 
528 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.435049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>