17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4877 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4877  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1153    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1099  hypothetical protein  31.62 
 
 
480 aa  165  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3653  hypothetical protein  32.5 
 
 
509 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000579216  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2412  hypothetical protein  31.28 
 
 
453 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2627  hypothetical protein  25.96 
 
 
530 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3118  hypothetical protein  34.08 
 
 
419 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.087045  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2120  hypothetical protein  22.19 
 
 
533 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981673  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0974  hypothetical protein  26.32 
 
 
591 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0973  hypothetical protein  28.07 
 
 
610 aa  89.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2199  hypothetical protein  25.35 
 
 
598 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0201  hypothetical protein  31.61 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00798209  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0400  hypothetical protein  23.47 
 
 
579 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0200  hypothetical protein  25.09 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14601  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0401  hypothetical protein  23.9 
 
 
502 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4963  hypothetical protein  27.07 
 
 
528 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2200  hypothetical protein  23.59 
 
 
592 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.813612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2472  hypothetical protein  23.59 
 
 
595 aa  47.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>