11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3871 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3871  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  100 
 
 
522 aa  1022    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.209528  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08511  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  43.88 
 
 
454 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0311  gamma-glutamyl carboxylase-like protein  43.05 
 
 
448 aa  350  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1329  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  42.98 
 
 
452 aa  350  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0669  gamma-glutamyl carboxylase-like protein  39.86 
 
 
456 aa  342  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.405906  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4531  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  42.86 
 
 
449 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.851231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1172  vitamin K-dependent gamma-carboxylase  39.01 
 
 
415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04035  gamma-glutamyl carboxylase-like protein  31.72 
 
 
447 aa  226  7e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  42.55 
 
 
684 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3598  HTTM domain protein  26.5 
 
 
521 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0340  hypothetical protein  28.67 
 
 
636 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>