23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2086 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2086  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  615  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0969177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1127  hypothetical protein  32.19 
 
 
339 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0601  hypothetical protein  29.05 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2361  hypothetical protein  30.27 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0163765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2283  hypothetical protein  27.96 
 
 
393 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0602  hypothetical protein  27.44 
 
 
342 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2149  hypothetical protein  27.96 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1390  hypothetical protein  27.72 
 
 
343 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216567  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4561  hypothetical protein  26.22 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0383  hypothetical protein  27.51 
 
 
338 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2281  hypothetical protein  28.2 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0603  hypothetical protein  26.9 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2004  hypothetical protein  29.09 
 
 
363 aa  93.6  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.069614  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2066  hypothetical protein  23.72 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0580276  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4536  hypothetical protein  24.65 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4856  hypothetical protein  24.58 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.640444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0604  hypothetical protein  25.09 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2917  hypothetical protein  23.11 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2954  hypothetical protein  24.44 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4541  hypothetical protein  25.84 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.420178  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4858  hypothetical protein  25.63 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.615525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1444  hypothetical protein  24.64 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2670  hypothetical protein  23.08 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.255363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>