23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1127 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1127  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  680    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0601  hypothetical protein  31.83 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0602  hypothetical protein  33.02 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2149  hypothetical protein  31.37 
 
 
342 aa  166  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2361  hypothetical protein  30.46 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0163765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1390  hypothetical protein  31.75 
 
 
343 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216567  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2283  hypothetical protein  34.21 
 
 
393 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2086  hypothetical protein  32.19 
 
 
312 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0969177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2066  hypothetical protein  25.62 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0580276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0603  hypothetical protein  29.52 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0604  hypothetical protein  27.48 
 
 
362 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4536  hypothetical protein  28.66 
 
 
355 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4561  hypothetical protein  27.95 
 
 
338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2281  hypothetical protein  29.45 
 
 
351 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4856  hypothetical protein  30.38 
 
 
355 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.640444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0383  hypothetical protein  26.71 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2004  hypothetical protein  27.83 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.069614  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2917  hypothetical protein  27.9 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4858  hypothetical protein  30.12 
 
 
303 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.615525  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4541  hypothetical protein  30.28 
 
 
303 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.420178  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1444  hypothetical protein  27.95 
 
 
325 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2954  hypothetical protein  26.44 
 
 
378 aa  85.9  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2670  hypothetical protein  26.11 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.255363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>