23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1444 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1444  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  646    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2281  hypothetical protein  32.81 
 
 
351 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0604  hypothetical protein  30.45 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0601  hypothetical protein  30.07 
 
 
345 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4541  hypothetical protein  29.35 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.420178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2954  hypothetical protein  25.24 
 
 
378 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4536  hypothetical protein  29.5 
 
 
355 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4858  hypothetical protein  29.17 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.615525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2917  hypothetical protein  29.13 
 
 
327 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1390  hypothetical protein  28.09 
 
 
343 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216567  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4856  hypothetical protein  26.18 
 
 
355 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.640444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0602  hypothetical protein  26.92 
 
 
342 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2149  hypothetical protein  28.08 
 
 
342 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1127  hypothetical protein  27.95 
 
 
339 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2361  hypothetical protein  28.01 
 
 
356 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0163765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2066  hypothetical protein  23.94 
 
 
335 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0580276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0383  hypothetical protein  26.92 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2004  hypothetical protein  27.86 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.069614  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4561  hypothetical protein  26.92 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2283  hypothetical protein  25.56 
 
 
393 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0603  hypothetical protein  26.79 
 
 
350 aa  89.7  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2670  hypothetical protein  29.72 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.255363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2086  hypothetical protein  24.64 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0969177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>