13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0466 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0466  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  355  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.275121  normal  0.508236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  37.14 
 
 
641 aa  78.2  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2040  hypothetical protein  34.51 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  34.23 
 
 
684 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0035  hypothetical protein  32.74 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1174  hypothetical protein  34.05 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  29.28 
 
 
638 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2954  hypothetical protein  36.75 
 
 
241 aa  54.7  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1945  hypothetical protein  35.16 
 
 
242 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  29.41 
 
 
652 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2560  hypothetical protein  26.9 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0399  hypothetical protein  35.42 
 
 
277 aa  41.2  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  29.11 
 
 
828 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>