37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1316 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1316  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0581  hypothetical protein  42.11 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0201076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  31.88 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  29.13 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  34.47 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  30.21 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  27.45 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  32.31 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  28.95 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  30.37 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  25.2 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  30.89 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  28.93 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  31.28 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  27.9 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  30.88 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  28.43 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  29.52 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  28.43 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  28.43 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  26.72 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  27.47 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  27.49 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  27.9 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  27.47 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  29.55 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  30.1 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  29.59 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  30.23 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  29.2 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  23.44 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  29.2 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  28.75 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  30.06 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  28.76 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>