14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3819 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3819  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  232  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00636659  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.18 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  31.03 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  28.7 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.67 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  30.7 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  28.95 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  26.96 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  26.96 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1487  multidrug ABC transporter  40.91 
 
 
112 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000289174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>