More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1102 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1102  putative cell division protein FtsW  100 
 
 		 553 aa  1113    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0180  cell division membrane protein  51.17 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0142339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1283  cell division protein FtsW  41.05 
 
 		 411 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1073  cell division protein FtsW  40.77 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10800  cell division membrane protein  38.61 
 
 		 501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  32.52 
 
 		 511 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  32.52 
 
 		 511 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  32.52 
 
 		 511 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16580  cell division protein FtsW  37.94 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1570  cell division protein FtsW  37.11 
 
 		 447 aa  210  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22810  cell division protein FtsW  41.09 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.716468  decreased coverage  0.00888407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3064  cell division protein FtsW  35.47 
 
 		 417 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  32.34 
 
 		 501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3200  cell division protein FtsW  35.83 
 
 		 443 aa  200  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0380668  normal  0.212803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  32.07 
 
 		 506 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1595  cell division protein FtsW  39.32 
 
 		 407 aa  199  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.800605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  36.24 
 
 		 539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1569  cell division protein FtsW  36.34 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3264  cell division protein FtsW  35.8 
 
 		 536 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34140  cell division membrane protein  36.16 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal  0.168594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  32.25 
 
 		 543 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0896  cell division protein FtsW  35.12 
 
 		 476 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.560244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13610  cell division protein FtsW  38.14 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.169189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12184  cell division protein ftsW  31.98 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000239985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2869  cell division membrane protein-like protein  31.79 
 
 		 441 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6114  cell division protein FtsW  34.58 
 
 		 417 aa  183  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309326  normal  0.0125207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  33.72 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  34.26 
 
 		 427 aa  180  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  31.25 
 
 		 417 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1009  cell division protein FtsW  34.2 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172249  normal  0.019811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  31.48 
 
 		 368 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2411  cell cycle protein  38.35 
 
 		 436 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.293513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  32.41 
 
 		 474 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  33.33 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4012  cell cycle protein  29.87 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  30.92 
 
 		 368 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3471  cell division protein FtsW  34.57 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162796  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1109  cell division protein FtsW  34.83 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0900673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  36.5 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3129  cell cycle protein  32.95 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0462  cell division protein FtsW  32.67 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0487  cell division protein FtsW  32.67 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0485  cell division transmembrane protein, FtsW  33.64 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  32.96 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0076  cell division protein FtsW  29.9 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0558  cell division protein FtsW  29.9 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1414  cell cycle protein  32.32 
 
 		 530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00165881  normal  0.0788928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  32.95 
 
 		 413 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0529  cell division protein FtsW  29.9 
 
 		 427 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704536  normal  0.739964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2845  cell division FtsW transmembrane protein  31.71 
 
 		 413 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  32.95 
 
 		 413 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3644  cell cycle protein  29.9 
 
 		 427 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2837  cell division protein FtsW  33.55 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3526  cell division protein FtsW  34.23 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0658  cell cycle protein  31.73 
 
 		 380 aa  162  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3546  cell division protein FtsW  33.89 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  33.06 
 
 		 374 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3231  cell division protein FtsW  33.89 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2552  cell division protein FtsW  33.89 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1332  cell division protein FtsW  33.89 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3551  cell division protein FtsW  33.89 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0473  cell division protein FtsW  33.89 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3018  cell division protein FtsW  32.7 
 
 		 570 aa  160  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  31.41 
 
 		 361 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1117  cell division protein FtsW  32.89 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1607  cell division protein FtsW  32.18 
 
 		 396 aa  158  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  33.72 
 
 		 424 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  33.06 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  31.55 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09500  cell division membrane protein  32.94 
 
 		 606 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0513587 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  31.83 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1406  cell division protein FtsW  31.69 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  0.0641122 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1180  cell division membrane protein  30.19 
 
 		 394 aa  154  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000279233  hitchhiker  0.000901206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  32 
 
 		 375 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  30.33 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  31.3 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  28.38 
 
 		 375 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  33.71 
 
 		 354 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1031  cell division protein FtsW  30.77 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2980  cell cycle protein  32.39 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  34 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  35 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0523  cell division protein  29.32 
 
 		 426 aa  149  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  31.01 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  35.06 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4569  cell division protein FtsW  26.43 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0761  cell cycle protein FtsW  31.04 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00222867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0820  cell division protein FtsW  29.16 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  30.28 
 
 		 359 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0975  stage V sporulation protein E  29.97 
 
 		 383 aa  146  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000101202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4064  stage V sporulation protein E  33.05 
 
 		 364 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3440  cell cycle protein  29.95 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3469  cell division protein FtsW  28.17 
 
 		 391 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.597104  normal  0.0182976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08840  cell division membrane protein  32.96 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  32.64 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  32.64 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0740  cell division protein FtsW  33.33 
 
 		 380 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  32.29 
 
 		 364 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1112  cell division protein FtsW  30.05 
 
 		 393 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0957  cell division protein FtsW  32.2 
 
 		 394 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.343907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>