19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3648 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3648  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  157  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0597  hypothetical protein  51.39 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2913  hypothetical protein  42.47 
 
 
77 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0380282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1709  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1697  hypothetical protein  36.84 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3410  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2925  hypothetical protein  45.61 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0581783  hitchhiker  0.000000000000134727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3501  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2461  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1717  hypothetical protein  48.84 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2927  hypothetical protein  35.14 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  hitchhiker  0.0000000000000262832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3409  hypothetical protein  50.94 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0681  hypothetical protein  43.86 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0668  hypothetical protein  42.11 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2915  hypothetical protein  57.14 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0257114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3502  hypothetical protein  48.53 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2462  hypothetical protein  45.59 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3650  hypothetical protein  35.38 
 
 
81 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1698  hypothetical protein  34.29 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>