17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2461 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2461  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  151  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3501  hypothetical protein  97.4 
 
 
77 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3410  hypothetical protein  78.95 
 
 
76 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2913  hypothetical protein  70.31 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0380282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2927  hypothetical protein  68.75 
 
 
76 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  hitchhiker  0.0000000000000262832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0668  hypothetical protein  41.03 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0681  hypothetical protein  39.02 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3075  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3650  hypothetical protein  41.94 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1697  hypothetical protein  37.5 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1715  hypothetical protein  36.49 
 
 
88 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000674552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0919  hypothetical protein  40.68 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00217727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2711  hypothetical protein  51.11 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2912  hypothetical protein  38.96 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1313  hypothetical protein  43.55 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0597  hypothetical protein  37.7 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1698  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>