16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2927 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2927  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  hitchhiker  0.0000000000000262832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2913  hypothetical protein  62.34 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0380282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2461  hypothetical protein  68.75 
 
 
77 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3501  hypothetical protein  67.19 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3410  hypothetical protein  70.69 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3075  hypothetical protein  55.1 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0681  hypothetical protein  45.9 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0668  hypothetical protein  44.26 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3650  hypothetical protein  50.79 
 
 
81 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2711  hypothetical protein  59.52 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1313  hypothetical protein  44.23 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2912  hypothetical protein  44.23 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0597  hypothetical protein  39.34 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0919  hypothetical protein  37.25 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00217727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1697  hypothetical protein  35.48 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1715  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000674552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>