19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0597 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0597  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2925  hypothetical protein  71.43 
 
 		 79 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0581783  hitchhiker  0.000000000000134727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0683  hypothetical protein  47.22 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000953444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0670  hypothetical protein  47.22 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2915  hypothetical protein  56.52 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0257114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3648  hypothetical protein  51.39 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3409  hypothetical protein  46.3 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2913  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0380282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1717  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0687  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000116529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3502  hypothetical protein  46.03 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0674  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1709  hypothetical protein  39.39 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2927  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  hitchhiker  0.0000000000000262832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2462  hypothetical protein  46.03 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3410  hypothetical protein  51.16 
 
 		 76 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2461  hypothetical protein  37.7 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1697  hypothetical protein  32.89 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3501  hypothetical protein  36.07 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>