12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4815 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4815  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  407  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00408258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3636  hypothetical protein  66.49 
 
 
192 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3945  hypothetical protein  46.23 
 
 
276 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3743  hypothetical protein  54.4 
 
 
308 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0811  hypothetical protein  47.51 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0520  hypothetical protein  50.8 
 
 
248 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.492026  normal  0.0461239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0070  hypothetical protein  47.78 
 
 
243 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1126  hypothetical protein  39.22 
 
 
263 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.630072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2969  hypothetical protein  37.74 
 
 
165 aa  45.1  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  34.86 
 
 
339 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  34.86 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  30.58 
 
 
304 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>