15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3310 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3310  putative lipoprotein  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0428  putative lipoprotein  70.65 
 
 		 184 aa  280  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.750939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1202  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  41.38 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0733  hypothetical protein  38.51 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0616  hypothetical protein  38.51 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.461057  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0727  hypothetical protein  38.51 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.942214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2135  hypothetical protein  38.51 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2037  hypothetical protein  38.51 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1685  hypothetical protein  38.51 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0858  hypothetical protein  37.84 
 
 		 268 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3048  hypothetical protein  40.56 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0014  hypothetical protein  29.46 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  31.39 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>